Wprawdzie historia Wydziału Filozoficznego sięga wieków temu, gdyż wywodzi się z dawnego Wydziału Teologii Uniwersytetu Jagiellońskiego, ale uwarunkowania historyczne sprawiły, że dziś świętować przychodzi 40-lecie tego wydziału. W 1970 roku, dzięki staraniom ks. prof. Mariana Jaworskiego, podjęto decyzję o podzieleniu Wydziału Teologicznego, w wyniku czego powstała sekcja filozofii. W sprawie powołania Wydziału Filozoficznego nie ustawał w wysiłkach ks. kard. Karol Wojtyła. 23 grudnia 1976 roku Kongregacja Wychowania Katolickiego wydała dekret ustanawiający Papieski Wydział Filozoficzny. Realizacja dekretu, ze względu na sytuację polityczną, odbywała się jednak etapami. Zwieńczenie starań kard. Karola Wojtyły możliwe stało się dopiero po wyniesieniu go na Stolicę Piotrową. 8 grudnia 1981 roku Jan Paweł II ustanowił na mocy
motu proprio Beata Hedvigis Papieską Akademię Teologiczną, składającą się z trzech wydziałów, w tym Wydziału Filozoficznego.
Program